Juicebox VR

एक आभासी वास्तविकता के वातावरण में हाय-सी 3 डी जीनोम अनुक्रमण डेटा का अन्वेषण करें!

Juicebox वी.आर. तीन आयामी जीनोम अनुक्रमण के लिए हाय-सी विधि द्वारा उत्पन्न डेटा के एक आभासी वास्तविकता प्रतिनिधित्व बनाता है। परिदृश्य में हर 2 डी स्थिति तीन अरब पत्र-लंबी मानव जीनोम में, 1D की स्थिति, या loci के एक जोड़ी से मेल खाती है। 2 डी स्थिति में ऊंचाई दो लोकी एक सेल के नाभिक में संपर्क में हैं कितनी बार प्रतिनिधित्व करता है।

आस-पास के स्थलों अक्सर एक दूसरे में टक्कर के बाद से, कम दूरी के संपर्कों का एक विशाल 'दीवार' परिदृश्य bisects। स्क्वायर पठारों गाढ़ा जीनोमिक डोमेन, कहा जाता संपर्क डोमेन के लिए विकर्ण अनुरूप बंद आ रहा है। परिदृश्य में चोटियों जीनोम में छोरों के अनुरूप हैं। संपर्क डोमेन अक्सर वर्ग डोमेन के अक्सर उनके कोने में चोटियों है, यही वजह है छोरों द्वारा सीमांकन कर रहे हैं।

नियंत्रक तुम देखो, जो भी दिशा में उड़ जाएगा। सीधे एक सुपर कूद के लिए ऊपर देखो।

Juicebox वी.आर. मुहम्मद शमीम, इडौ Machol, और Erez लिबरमैन Aiden द्वारा बनाया गया था।

डेटा से तैयार किया जाता है:

सुहास राव *, मरियम Huntley *, नेवा सी डूरंड, ऐलेना Stamenova, इवान Bochkov, जिम रॉबिन्सन, एड्रियन सैनबोर्न, इडौ Machol, Arina ओमर, एरिक लैंडर और Erez लिबरमैन Aiden। Kilobase प्रस्ताव पर मानव जीनोम का एक 3 डी मानचित्र Chromatin पाशन, सेल (2014) के सिद्धांतों का पता चलता है।

* समान रूप से योगदान

परिदृश्य उत्पन्न करने के लिए इस्तेमाल किया डेटा एक पूर्ण, जीनोम चौड़ा नक्शे से एक अत्यंत छोटे क्षेत्र है कि ध्यान दें। मानव जीनोम के लिए पूर्ण संपर्क नक्शा इस नक्शे की तुलना में एक खरब गुना बड़ा है।

Www.aidenlab.org पर हमारे काम के बारे में और अधिक जानें।

संगीत: Stellardrone द्वारा चढ़ाई

महत्वपूर्ण: ठीक से एप्लिकेशन को देखने के लिए, जैसे गूगल गत्ता, Durovis कूदो, या सैमसंग गियर वी.आर. के रूप में एक आभासी वास्तविकता हेडसेट, इस्तेमाल किया जाना चाहिए।